Ідея створення Музею історії університету вперше виникла 1974 р., однак лише до 40-й річниці «визволення» Закарпаття у 1984 р. його було відкрито. Не належна увага до фондів музею призвела в середині 1990-х рр. до припинення його функціонування. 

7 лютого 2013 р. в приміщенні історичного факультету наказом ректора було створено Музей історії університету. Завідувачем музею призначено Ігоря Зомбора. Станом на сьогодні завершується збір текстового, фото-ілюстраційного та експозиційного матеріалу  від основних структурних підрозділів університету. Головною метою музейного підрозділу буде презентувати здобутки вищої освіти в Закарпатті, починаючи від єзуїтського колегіуму (1613-1615 рр.) до сучасних досягнень ДВНЗ «УжНУ». 

В експозиційному залі Музею буде представлено максимально повне відображення історії виникнення, розвитку та сучасного становлення УжНУ, як провідного закладу вищої  освіти та визнаного наукового центру.